SMP Muhammadiyah 13 Surabaya memiliki fasilitas yang dapat mendukung proses belajar Siswa/Sisw, yang meliputi
- Tenaga pendidik berdedikasi, terampil dan berpengalaman
- Gedung sekolah yang representatif
- Ruang kelas ber-AC
- Perpustakaan
- Masjid
- Lab. Komputer dan Free Wifi Zone
- Ruang konseling
- Kantin
- Ruang Lab IPA
- Ruang Lab komputer
- Ruang Perpustakaan
- Internet di area sekolah
- Beasiswa untuk siswa berprestasi dan siswa yang tidak mampu
